苗木销售应当开具增值税发票，如果销售方属于一般纳税人，则对于一般纳税人企业购买苗木应当开具增值税专用发票，如果是小规模纳税人，则应当开具增值税普通发票；苗木销售方如果是小规模纳税人，则根据购买企业实际情况可以开具增值税普通发票或者到税务机关代开增值税专用发票；如果苗木销售方为种植农户，则可以根据需要，到当地税务机关去代开增值税普通发票或者增值税专用发票。