可以在异地办理的。目前我国有43个城市允许非本市户籍人员办理港澳通行证，但要满足一定的条件，这43个城市分别是，北京、天津、石家庄、太原、呼和浩特、沈阳、大连、长春，哈尔滨、上海、南京、杭州、宁波、合肥、福州、厦门、南昌、济南、青岛、郑州、武汉、长沙、广州、深圳、南宁、海口、重庆、成都、贵阳、昆明 西安 、无锡、常州、苏州、温州、嘉兴、舟山、泉州、株洲、湘潭、珠海、东莞、佛山首先确定本人是否在这些城市之内，否则只能回户籍所在地办理，首次办理港澳通行证不能委托他人代办，续签可以由他人代办。