软件申请知识产权保护的方式： 1、著作权无需申请，软件著作权自软件开发完成之日起产生； 2、专利权，应当依法申请专利，经专利行政机关审查，无反驳理由的。发给专利证书； 3、其他方式。

法律依据： 《计算机软件保护条例》第十四条 软件著作权自软件开发完成之日起产生。 自然人的软件著作权，保护期为自然人终生及其死亡后50年，截止于自然人死亡后第50年的12月31日；软件是合作开发的，截止于最后死亡的自然人死亡后第50年的12月31日。 法人或者其他组织的软件著作权，保护期为50年，截止于软件首次发表后第50年的12月31日，但软件自开发完成之日起50年内未发表的，本条例不再保护。

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