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可以的，条件符合就可以的：①凡具有本市正式农业户口，家庭人均年收入低于农户所在地当年低保标准的纳入保障范围。 ②在现居住地定居一年以上，夫妻一方持有本市农业户口但其配偶及子女为外省市或本市其他区县农业户口的，家庭年人均收入比所在地区年低保标准低的成员。 ③其他符合享受农村低保待遇的人员。 ④具有正常劳动能力，但无正当理由拒绝劳动由自己懒惰造成贫困的以及逃避法律造成贫困的不属于低保保障的范围。

这边说了，条件符合就好了，你父亲的事情对于你们家这个建档立卡 没有影响，只要你们家庭有困难，需要政府资助，就可以申请。