区别在于：适用主体不同、特点不同、种类不同。

1、适用主体不同：劳动合同适用的主体为企业，聘用合同适用的范围主要为事业单位。聘用合同是事业单位人事制度改革的产物，聘用合同制度的内容反映了事业单位的用人制度通过订立劳动合同以实现其物质产品的生产。 2、特点不同：聘用合同具有特定性、法定性弱、单一性、诺成双务；劳动合同主体具有特定性、具有劳动权利和义务的统一性和对应性、具有诺成、有偿、双务合同的特征。 3、种类不同：聘用合同分为短期、中长期合同；劳动合同有固定期限劳动合同，是指用人单位与劳动者约定合同终止时间的劳动合同。无固定期限劳动合同，是指用人单位与劳动者约定无确定终止时间的劳动合同。原劳动法规定的长期合同。单项劳动合同，即没有固定期限，以完成一定工作任务为期限的劳动合同。

聘用合同是事业单位与职工按照国家的有关法律、政策，在平等自愿、协商一致的基础上，订立的关于履行有关工作职责的权利义务关系的协议。了解和认识聘用合同的特征，作为管理人员可以在实践中更好地运用聘用合同这一形式，推进我国事业单位用人制度的改革；作为事业单位和其受聘人员，可以更好地运用这一形式维护其自身的合法权益。

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