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食品黑作坊应向工商局部门举报。工商局的主要职能如下： 负责市场监督管理和行政执法的有关工作，起草有关法律法规草案，制定工商行政管理规章和政策。 负责各类企业、农民专业合作社和从事经营活动的单位、个人以及外国(地区)企业常驻代表机构等市场主体的登记注册并监督管理，承担依法查处取缔无照经营的责任。 承担监督管理流通领域商品质量责任，组织开展有关服务领域消费维权工作，按分工查处假冒伪劣等违法行为，指导消费者咨询、申诉、举报受理、处理和网络体系建设等工作，保护经营者、消费者合法权益。

可工商局举报无照经营，电话是区号加12315，可城管举报居民用房生产，电话是12319。

如果对方的黑作坊发生的噪音或者是排出来的污水给您这边带来了损害的话，你这边先收集证据，诸如录像录音，您这边医院的诊断都是可以的，后续再提起民事诉讼要求对方赔偿的亲

起诉流程：一、当事人起诉，提交起诉书。二、根据谁主张谁举证原则，原告向法院提交相应材料。三、当事人向法院提交书证。四、立案庭办理立案手续;对不符合立案条件的，依法裁定不予受理。五、当事人预交案件受理费和其他诉讼费用。六、立案手续后，案件由法院排期开庭。