个人同时在两家以上公司任职，由所在公司分别按每个月每个公司的所得金额分别申报个人所得税，年终的时候需要由个人进行个人所得税的年度汇算清缴申报，把多处的工资合并一起计算纳税，并实行多退少补

个人所得税综合所得汇算清缴的相关要求规定： 1、纳税人在2019年度已依法预缴个人所得税且符合下列情形之一的，无需办理年度汇算：纳税人年度汇算需补税但年度综合所得收入不超过12万元的；纳税人年度汇算需补税金额不超过400元的；纳税人已预缴税额与年度应纳税额一致或者不申请年度汇算退税的。 2、委托涉税专业服务机构或其他单位及个人办理，受托人需与纳税人签订授权书。扣缴义务人或受托人为纳税人办理年度汇算后，应当及时将办理情况告知纳税人。纳税人发现申报信息存在错误的，可以要求扣缴义务人或受托人办理更正申报，也可自行办理更正申报。

按照个人所得税法第九条、个人所得税法实施条例第三十六条的规定，纳税人从中国境内两处或者两处以上取得工资、薪金所得的，应于取得所得的次月十五日内，选择并固定在其中一处任职受雇单位所在地的主管地税机关办理自行纳税申报。

申报时填制《个人所得税两处或两处以上工资、薪金所得纳税申报表》。将各处取得工资、薪金所得合并后，按税法规定的税率计算出应纳税额，送去单位发放时代扣代缴的个税额后，为自行申报补缴个税款。 纳税人的工资、薪金所得，先行以每月收入额减除费用五千元以及专项扣除和依法确定的其他扣除后的余额为应纳税所得额，依照个人所得税税率表（综合所得适用）按月换算后计算缴纳税款，并不再扣除附加减除费用。

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如果在两家公司任职，只能与一家公司签订劳动合同，和另一家公司签劳务合同。两种合同的区别是，劳动合同是正式员工，需要依法缴纳社保和公积金，工资收入按工资薪金纳税；劳务合同算兼职员工，不用交社保和公积金，工资收入按劳务报酬所得纳税