纳税人取得的免税发票如果是从农业生产者处（包括农民专业合作社、“公司+农户”经营模式下）取得的，可以计算抵扣进项税额。但如果是用于免税项目、简易计税项目、集体福利、个人消费范围的，纳税人取得农业生产者开具的销售发票不得计算抵扣进项税额。

纳税人取得的免税发票如果是从农业生产者处（包括农民专业合作社、“公司+农户”经营模式下）取得的，可以计算抵扣进项税额。

其他情况是是不允许抵扣的

企业购入农产品取得免税发票能否抵扣进项税额，要看来源，只有从农业生产者自产自销环节取得的农产品免税发票才可以计算抵扣进项税额，从批发、零售等环节取得的免税发票则不得抵扣进项税额。

增值税一般纳税人购进农产品，取得农产品销售发票，此类发票从票面形式看就是一张增值税的普通发票，税率栏显示的是“免税”，可抵扣的税额需要计算得出，以农产品销售发票上注明的农产品买价和9%的扣除率计算进项税额。比如：取得一张金额是10000元的农业合作社开具的农产品发票，购买方可抵扣的税额=10000×9%=900（元），10000减去900的余额9100元作为成本费用入账。

购买的农业机械免税发票，如果是用于免税项目、简易计税项目、集体福利、个人消费范围的，纳税人取得农业生产者开具的销售发票不得计算抵扣进项税额。

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