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《中华人民共和国民法典》 第二百零九条 不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。 依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。 第二百一十条 不动产登记，由不动产所在地的登记机构办理。 国家对不动产实行统一登记制度。统一登记的范围、登记机构和登记办法，由法律、行政法规规定。

您说的漏水不许您建二层没有法律规定

只要是您的宅基地加上您取得加盖第二层的行政许可，您就可以建第二层

加盖楼层，需先申请，是需要经过审批的，未办理相关审批手续，会被作为违章建筑予以拆除。

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