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实习生签了协议辞职要扣除半个月的工资是不合法的，劳动者可以向当地的劳动监察部门进行投诉或者申请劳动仲裁。 　　用人单位拖欠劳动者的工资，劳动者有3个途径可以要求支付工资： 　　1、劳动者可以到当地人力资源和社会保障局劳动监察投诉；优点：方式简单。缺点：各地执法力度可能不是很大； 　　2、可以到当地人力资源和社会保障局劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求支付工资。如果未签订劳动合同，可以要求支付未签订劳动合同的双倍工资。如果是以拖欠工资提出的解除劳动关系，还可以要求支付经济补偿金。优点：除了工资外，还可以主张经济补偿、双倍工资等，并且一般都可以最终解决；缺点：申请劳动仲裁就是打劳动官司，程序稍多，需要专业人士指导。 　　3、有欠条的，可以直接起诉到法院，要求支付欠条里的工资数额。

　　《劳动争议调解仲裁法》第二条 中华人民共和国境内的用人单位与劳动者发生的下列劳动争议，适用本法： 　　（一）因确认劳动关系发生的争议； 　　（二）因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议； 　　（三）因除名、辞退和辞职、离职发生的争议； 　　（四）因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议； 　　（五）因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议； 　　《劳动法》第五十条　工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。

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