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汇算清缴中应纳税所得额为负数，一般来说是因为纳税人预缴税款时交多了。遇到这种情况可以申请退税，或者留待以后年度抵减。如果不申请退税，需要在下一年度缴税时填写《多缴税款抵交应纳税款表》，申请抵减。

根据规定，在纳税年度内，纳税人预缴企业所得税税款少于应缴的税款，应在汇算清缴期内结清应补缴的税款;预缴税款多于应纳税款的，税务机关按规定办理退税或者经纳税人同意后税款抵减下一年度应缴税款。即多交的税款可以抵减以后月度(年度)的所得税税款，如果这一季度多交了，下一季度就少交，在下次申报时将本期多交的税款填列在“上期已预交所得税一栏”，报表中就自动反应本期要交的税，即用上期多交税款在本期抵减。

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