非法买卖危险物质罪的立案标准是：非法制造、买卖、运输、储存毒害性、放射性、传染病病原体等物质，危害公共安全，造成人员重伤或者死亡的，造成直接经济损失十万元以上的。非法买卖、运输、储存毒鼠强、氟乙酰胺、氟乙酰钠、毒鼠硅、甘氟原粉、原液、制剂五十克以上，或者饵料二千克以上的等，应当立案。