公安机关办理行政案件的程序是：1、展示执法状况；2、收集证据；3、告知处罚决定的事实、理由和依据，告知依法陈述和辩护的权利；4、听取陈述和辩护，事实、理由或者证据成立的，予以采纳；5、填写处罚决定书，交给被处罚人；6、当场收缴，填写收据，交给被处罚人；未当场收缴，通知被处罚人限期到指定银行缴纳罚款。