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按《建筑工程施工许可管理办法》第二条：在中华人民共和国境内从事各类房屋建筑及其附属设施的建造、装修装饰和与其配套的线路、管道、设备的安装，以及城镇市政基础设施工程的施工，建设单位在开工前应当依照本办法的规定，向工程所在地的县级以上人民政府建设行政主管部门(以下简称发证机关)申请领取施工许可证。

如果无证的厂房是属于违章建筑或者临时建筑的，是不会给予补偿的。《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十四条　市、县级人民政府及其有关部门应当依法加强对建设活动的监督管理，对违反城乡规划进行建设的，依法予以处理。市、县级人民政府作出房屋征收决定前，应当组织有关部门依法对征收范围内未经登记的建筑进行调查、认定和处理。对认定为合法建筑和未超过批准期限的临时建筑的，应当给予补偿；对认定为违法建筑和超过批准期限的临时建筑的，不予补偿。

那您这边房产证是不能办下来吗

造成房屋没有产权证或证件不全，有一定历史因素，也有法律规定不明确的原因。在这种复杂的背景下不能简单粗暴的以是否有相关证件作为认定建筑合法与否的唯一标准，应当结合当时建造时的法律法规来进行综合的判断。建议提起行政诉讼。

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