农产品收购本身是免税的，农副产品收购发票可以按发票票面金额抵扣9%进项税率。 收购金额*9%，这就是进项抵扣的金额。 纳税人销售货物或者应税劳务适用免税规定的，可以放弃免税，依照条例的规定缴纳增值税。放弃免税后，36个月内不得再申请免税。因此，合作社也可以放弃免税，以取得专用发票的使用权。

《中华人民共和国增值税暂行条例》 第十五条 下列项目免征增值税： （一）农业生产者销售的自产农产品； （二）避孕药品和用具； （三）古旧书； （四）直接用于科学研究、科学试验和教学的进口仪器、设备； （五）外国政府、国际组织无偿援助的进口物资和设备； （六）由残疾人的组织直接进口供残疾人专用的物品； （七）销售的自己使用过的物品。 除前款规定外，增值税的免税、减税项目由国务院规定。任何地区、部门均不得规定免税、减税项目。

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