1、在省一级，监狱管理局和司法厅是各自独立的平级机关。 2、在地级市一级，不设监狱管理局。 3、在国务院中央一级，监狱管理局设在司法部，隶属司法部。

监狱分为省直监狱和市属监狱，省直监狱一个省有十至三十来个不等，市属监狱一个省也就几个，（也有国家监狱：唯一由公安部管理的，即公安部十三局直接管理的秦城监狱，再者司法部直属的燕城监狱<正厅级，不归司法部监狱管理局管理>）。省直监狱为全国监狱的主体，他们由省（市<直辖市>、自治区、兵团）监狱管理局直管。设区的市（地级市）没有监狱管理局，市属监狱由市级司法局（正处级）直接管理，市属监狱未来改革方向是将悉数改为省直；

监狱管理局是省（市<直辖市>、自治区、兵团）司法厅（局）的组成部门，业务独立办公。注意，不是直属部门，国务院也分组成部门和直属部门（外交部是组成部门、国家市场监督管理总局是直属部门，区别在于国务院召集会议，这两种部门有无应当的出席权），司法厅正厅级，监狱管理局副厅级，局长进厅党组（司法厅没有党委，一般都是党组）的，一般都是兼副厅长。市（地级）司法局由当地市政府和上级司法厅双重领导，本地政府主管组织和财务，上级司法部门主管业务，很多地级市的司法局没有监狱管理。省直监狱组织、财政、业务均归省管（省监狱管理局为主，司法厅也有若干相应部门）；市属监狱组织、财政由市司法局管辖、业务归省监狱局管理；秦城燕城两狱另当别论

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